Theo đánh giá của ngành chức năng, các trạm xử lý nước thải đô thị trên địa bàn thành phố Phủ Lý thời gian qua chưa phát huy hiệu quả do việc đầu tư xây dựng không đồng bộ, thiếu mạng lưới thu gom nước thải cấp 2, cấp 3.